TY - JOUR AU - Turnbaugh, P. J. AU - Ley, R. E. AU - Mahowald, M. A. AU - Magrini, V. AU - Mardis, E. R. AU - Gordon, J. I. PY - 2006 DA - 2006// TI - An obesity-associated gut microbiome with increased capacity for energy harvest JO - Nature VL - 444 UR - https://doi.org/10.1038/nature05414 DO - 10.1038/nature05414 ID - Turnbaugh2006 ER - TY - JOUR AU - Turnbaugh, P. J. AU - Backhed, F. AU - Fulton, L. AU - Gordon, J. I. PY - 2008 DA - 2008// TI - Diet-induced obesity is linked to marked but reversible alterations in the mouse distal gut microbiome JO - Cell Host Microbe VL - 3 UR - https://doi.org/10.1016/j.chom.2008.02.015 DO - 10.1016/j.chom.2008.02.015 ID - Turnbaugh2008 ER - TY - JOUR AU - Yassour, M. AU - Lim, M. Y. AU - Yun, H. S. AU - Tickle, T. L. AU - Sung, J. AU - Song, Y. M. AU - Lee, K. AU - Franzosa, E. A. AU - Morgan, X. C. AU - Gevers, D. PY - 2016 DA - 2016// TI - Sub-clinical detection of gut microbial biomarkers of obesity and type 2 diabetes JO - Genome Med VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/s13073-016-0271-6 DO - 10.1186/s13073-016-0271-6 ID - Yassour2016 ER - TY - JOUR AU - Wang, Z. AU - Klipfell, E. AU - Bennett, B. J. AU - Koeth, R. AU - Levison, B. S. AU - Dugar, B. AU - Feldstein, A. E. AU - Britt, E. B. AU - Fu, X. AU - Chung, Y. M. PY - 2011 DA - 2011// TI - Gut flora metabolism of phosphatidylcholine promotes cardiovascular disease JO - Nature VL - 472 UR - https://doi.org/10.1038/nature09922 DO - 10.1038/nature09922 ID - Wang2011 ER - TY - JOUR AU - Karlsson, F. H. AU - Fak, F. AU - Nookaew, I. AU - Tremaroli, V. AU - Fagerberg, B. AU - Petranovic, D. AU - Backhed, F. AU - Nielsen, J. PY - 2012 DA - 2012// TI - Symptomatic atherosclerosis is associated with an altered gut metagenome JO - Nat Commun VL - 3 UR - https://doi.org/10.1038/ncomms2266 DO - 10.1038/ncomms2266 ID - Karlsson2012 ER - TY - JOUR AU - Wu, G. D. AU - Chen, J. AU - Hoffmann, C. AU - Bittinger, K. AU - Chen, Y. -. Y. AU - Keilbaugh, S. A. AU - Bewtra, M. AU - Knights, D. AU - Walters, W. A. AU - Knight, R. PY - 2011 DA - 2011// TI - Linking long-term dietary patterns with Gut microbial enterotypes JO - Science VL - 334 UR - https://doi.org/10.1126/science.1208344 DO - 10.1126/science.1208344 ID - Wu2011 ER - TY - JOUR AU - David, L. A. AU - Maurice, C. F. AU - Carmody, R. N. AU - Gootenberg, D. B. AU - Button, J. E. AU - Wolfe, B. E. AU - Ling, A. V. AU - Devlin, A. S. AU - Varma, Y. AU - Fischbach, M. A. PY - 2014 DA - 2014// TI - Diet rapidly and reproducibly alters the human gut microbiome JO - Nature VL - 505 UR - https://doi.org/10.1038/nature12820 DO - 10.1038/nature12820 ID - David2014 ER - TY - JOUR AU - Turnbaugh, P. J. AU - Ridaura, V. K. AU - Faith, J. J. AU - Rey, F. E. AU - Knight, R. AU - Gordon, J. I. PY - 2009 DA - 2009// TI - The effect of diet on the human gut microbiome: a metagenomic analysis in humanized gnotobiotic mice JO - Sci Transl Med VL - 1 UR - https://doi.org/10.1126/scitranslmed.3000322 DO - 10.1126/scitranslmed.3000322 ID - Turnbaugh2009 ER - TY - JOUR AU - Ley, R. E. AU - Backhed, F. AU - Turnbaugh, P. AU - Lozupone, C. A. AU - Knight, R. D. AU - Gordon, J. I. PY - 2005 DA - 2005// TI - Obesity alters gut microbial ecology JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 102 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0504978102 DO - 10.1073/pnas.0504978102 ID - Ley2005 ER - TY - JOUR AU - Ley, R. E. AU - Turnbaugh, P. J. AU - Klein, S. AU - Gordon, J. I. PY - 2006 DA - 2006// TI - Microbial ecology: human gut microbes associated with obesity JO - Nature VL - 444 UR - https://doi.org/10.1038/4441022a DO - 10.1038/4441022a ID - Ley2006 ER - TY - JOUR AU - Daniel, H. AU - Gholami, A. M. AU - Berry, D. AU - Desmarchelier, C. AU - Hahne, H. AU - Loh, G. AU - Mondot, S. AU - Lepage, P. AU - Rothballer, M. AU - Walker, A. PY - 2014 DA - 2014// TI - High-fat diet alters gut microbiota physiology in mice JO - ISME J VL - 8 UR - https://doi.org/10.1038/ismej.2013.155 DO - 10.1038/ismej.2013.155 ID - Daniel2014 ER - TY - JOUR AU - Amato, K. R. AU - Yeoman, C. J. AU - Cerda, G. AU - Schmitt, C. A. AU - Cramer, J. D. AU - Miller, M. E. AU - Gomez, A. AU - Turner, T. R. AU - Wilson, B. A. AU - Stumpf, R. M. PY - 2015 DA - 2015// TI - Variable responses of human and non-human primate gut microbiomes to a Western diet JO - Microbiome VL - 3 UR - https://doi.org/10.1186/s40168-015-0120-7 DO - 10.1186/s40168-015-0120-7 ID - Amato2015 ER - TY - JOUR AU - Zhong, C. Y. AU - Sun, W. W. AU - Ma, Y. AU - Zhu, H. AU - Yang, P. AU - Wei, H. AU - Zeng, B. H. AU - Zhang, Q. AU - Liu, Y. AU - Li, W. X. PY - 2015 DA - 2015// TI - Microbiota prevents cholesterol loss from the body by regulating host gene expression in mice JO - Sci Rep VL - 5 UR - https://doi.org/10.1038/srep10512 DO - 10.1038/srep10512 ID - Zhong2015 ER - TY - JOUR AU - Ishibashi, S. AU - Brown, M. S. AU - Goldstein, J. L. AU - Gerard, R. D. AU - Hammer, R. E. AU - Herz, J. PY - 1993 DA - 1993// TI - Hypercholesterolemia in low density lipoprotein receptor knockout mice and its reversal by adenovirus-mediated gene delivery JO - J Clin Invest VL - 92 UR - https://doi.org/10.1172/JCI116663 DO - 10.1172/JCI116663 ID - Ishibashi1993 ER - TY - JOUR AU - Bieghs, V. AU - Gorp, P. J. AU - Wouters, K. AU - Hendrikx, T. AU - Gijbels, M. J. AU - Bilsen, M. AU - Bakker, J. AU - Binder, C. J. AU - Lutjohann, D. AU - Staels, B. PY - 2012 DA - 2012// TI - LDL receptor knock-out mice are a physiological model particularly vulnerable to study the onset of inflammation in non-alcoholic fatty liver disease JO - PLoS One VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0030668 DO - 10.1371/journal.pone.0030668 ID - Bieghs2012 ER - TY - JOUR AU - Boursier, J. AU - Mueller, O. AU - Barret, M. AU - Machado, M. AU - Fizanne, L. AU - Araujo-Perez, F. AU - Guy, C. D. AU - Seed, P. C. AU - Rawls, J. F. AU - David, L. A. PY - 2016 DA - 2016// TI - The severity of nonalcoholic fatty liver disease is associated with gut dysbiosis and shift in the metabolic function of the gut microbiota JO - Hepatology VL - 63 UR - https://doi.org/10.1002/hep.28356 DO - 10.1002/hep.28356 ID - Boursier2016 ER - TY - JOUR AU - Emoto, T. AU - Yamashita, T. AU - Sasaki, N. AU - Hirota, Y. AU - Hayashi, T. AU - So, A. AU - Kasahara, K. AU - Yodoi, K. AU - Matsumoto, T. AU - Mizoguchi, T. PY - 2016 DA - 2016// TI - Analysis of gut microbiota in coronary artery disease patients: a possible link between Gut microbiota and coronary artery disease JO - J Atheroscler Thromb VL - 23 UR - https://doi.org/10.5551/jat.32672 DO - 10.5551/jat.32672 ID - Emoto2016 ER - TY - JOUR AU - Napoli, C. AU - Nigris, F. AU - Welch, J. S. AU - Calara, F. B. AU - Stuart, R. O. AU - Glass, C. K. AU - Palinski, W. PY - 2002 DA - 2002// TI - Maternal hypercholesterolemia during pregnancy promotes early atherogenesis in LDL receptor-deficient mice and alters aortic gene expression determined by microarray JO - Circulation VL - 105 UR - https://doi.org/10.1161/hc1102.106792 DO - 10.1161/hc1102.106792 ID - Napoli2002 ER - TY - JOUR AU - Wiersma, H. AU - Gatti, A. AU - Nijstad, N. AU - Oude Elferink, R. P. AU - Kuipers, F. AU - Tietge, U. J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Scavenger receptor class B type I mediates biliary cholesterol secretion independent of ATP-binding cassette transporter g5/g8 in mice JO - Hepatology VL - 50 UR - https://doi.org/10.1002/hep.23112 DO - 10.1002/hep.23112 ID - Wiersma2009 ER - TY - JOUR AU - Dikkers, A. AU - Freak de Boer, J. AU - Annema, W. AU - Groen, A. K. AU - Tietge, U. J. PY - 2013 DA - 2013// TI - Scavenger receptor BI and ABCG5/G8 differentially impact biliary sterol secretion and reverse cholesterol transport in mice JO - Hepatology VL - 58 UR - https://doi.org/10.1002/hep.26316 DO - 10.1002/hep.26316 ID - Dikkers2013 ER - TY - JOUR AU - Veen, J. N. AU - Dijk, T. H. AU - Vrins, C. L. AU - Meer, H. AU - Havinga, R. AU - Bijsterveld, K. AU - Tietge, U. J. AU - Groen, A. K. AU - Kuipers, F. PY - 2009 DA - 2009// TI - Activation of the liver X receptor stimulates trans-intestinal excretion of plasma cholesterol JO - J Biol Chem VL - 284 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M109.014860 DO - 10.1074/jbc.M109.014860 ID - Veen2009 ER - TY - JOUR AU - Subramanian, S. AU - Goodspeed, L. AU - Wang, S. AU - Kim, J. AU - Zeng, L. AU - Ioannou, G. N. AU - Haigh, W. G. AU - Yeh, M. M. AU - Kowdley, K. V. AU - O’Brien, K. D. PY - 2011 DA - 2011// TI - Dietary cholesterol exacerbates hepatic steatosis and inflammation in obese LDL receptor-deficient mice JO - J Lipid Res VL - 52 UR - https://doi.org/10.1194/jlr.M016246 DO - 10.1194/jlr.M016246 ID - Subramanian2011 ER - TY - JOUR AU - Dikkers, A. AU - Tietge, U. J. F. PY - 2010 DA - 2010// TI - Biliary cholesterol secretion: More than a simple ABC JO - World J Gastroenterol VL - 16 ID - Dikkers2010 ER - TY - JOUR AU - Norlin, M. AU - Wikvall, K. PY - 2007 DA - 2007// TI - Enzymes in the conversion of cholesterol into bile acids JO - Curr Mol Med VL - 7 UR - https://doi.org/10.2174/156652407780059168 DO - 10.2174/156652407780059168 ID - Norlin2007 ER - TY - JOUR AU - Ridlon, J. M. AU - Kang, D. J. AU - Hylemon, P. B. AU - Bajaj, J. S. PY - 2014 DA - 2014// TI - Bile Acids and the Gut Microbiome JO - Curr Opin Gastroenterol VL - 30 UR - https://doi.org/10.1097/MOG.0000000000000057 DO - 10.1097/MOG.0000000000000057 ID - Ridlon2014 ER - TY - JOUR AU - Joyce, S. A. AU - Gahan, C. G. PY - 2016 DA - 2016// TI - Bile acid modifications at the microbe-host interface: potential for nutraceutical and pharmaceutical interventions in host health JO - Annu Rev Food Sci Technol VL - 7 UR - https://doi.org/10.1146/annurev-food-041715-033159 DO - 10.1146/annurev-food-041715-033159 ID - Joyce2016 ER - TY - JOUR AU - Lecomte, V. AU - Kaakoush, N. O. AU - Maloney, C. A. AU - Raipuria, M. AU - Huinao, K. D. AU - Mitchell, H. M. AU - Morris, M. J. PY - 2015 DA - 2015// TI - Changes in gut microbiota in rats fed a high fat diet correlate with obesity-associated metabolic parameters JO - PLoS One VL - 10 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0126931 DO - 10.1371/journal.pone.0126931 ID - Lecomte2015 ER - TY - JOUR AU - Clarke, S. F. AU - Murphy, E. F. AU - O’Sullivan, O. AU - Ross, R. P. AU - O’Toole, P. W. AU - Shanahan, F. AU - Cotter, P. D. PY - 2013 DA - 2013// TI - Targeting the microbiota to address diet-induced obesity: a time dependent challenge JO - PLoS One VL - 8 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0065790 DO - 10.1371/journal.pone.0065790 ID - Clarke2013 ER - TY - JOUR AU - Zhong, Y. AU - Nyman, M. AU - Fak, F. PY - 2015 DA - 2015// TI - Modulation of gut microbiota in rats fed high-fat diets by processing whole-grain barley to barley malt JO - Mol Nutr Food Res VL - 59 UR - https://doi.org/10.1002/mnfr.201500187 DO - 10.1002/mnfr.201500187 ID - Zhong2015 ER - TY - JOUR AU - Everard, A. AU - Lazarevic, V. AU - Gaia, N. AU - Johansson, M. AU - Stahlman, M. AU - Backhed, F. AU - Delzenne, N. M. AU - Schrenzel, J. AU - Francois, P. AU - Cani, P. D. PY - 2014 DA - 2014// TI - Microbiome of prebiotic-treated mice reveals novel targets involved in host response during obesity JO - ISME J VL - 8 UR - https://doi.org/10.1038/ismej.2014.45 DO - 10.1038/ismej.2014.45 ID - Everard2014 ER - TY - JOUR AU - Pereira, D. I. AU - Gibson, G. R. PY - 2002 DA - 2002// TI - Cholesterol assimilation by lactic acid bacteria and bifidobacteria isolated from the human gut JO - Appl Environ Microbiol VL - 68 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.68.9.4689-4693.2002 DO - 10.1128/AEM.68.9.4689-4693.2002 ID - Pereira2002 ER - TY - JOUR AU - Bosshard, P. P. AU - Zbinden, R. AU - Altwegg, M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Turicibacter sanguinis gen. nov., sp. nov., a novel anaerobic, Gram-positive bacterium JO - Int J Syst Evol Microbiol VL - 52 ID - Bosshard2002 ER - TY - JOUR AU - Chen, H. C. PY - 2001 DA - 2001// TI - Molecular mechanisms of sterol absorption JO - J Nutr VL - 131 ID - Chen2001 ER - TY - JOUR AU - Martinez, I. AU - Perdicaro, D. J. AU - Brown, A. W. AU - Hammons, S. AU - Carden, T. J. AU - Carr, T. P. AU - Eskridge, K. M. AU - Walter, J. PY - 2013 DA - 2013// TI - Diet-induced alterations of host cholesterol metabolism are likely to affect the gut microbiota composition in hamsters JO - Appl Environ Microbiol VL - 79 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.03046-12 DO - 10.1128/AEM.03046-12 ID - Martinez2013 ER - TY - JOUR AU - Heinemann, T. AU - Kullak-Ublick, G. A. AU - Pietruck, B. AU - Bergmann, K. PY - 1991 DA - 1991// TI - Mechanisms of action of plant sterols on inhibition of cholesterol absorption. Comparison of sitosterol and sitostanol JO - Eur J Clin Pharmacol VL - 40 UR - https://doi.org/10.1007/BF03216292 DO - 10.1007/BF03216292 ID - Heinemann1991 ER - TY - STD TI - Baumgartner S, Mensink RP, Smet E, Konings M, Fuentes S, de Vos WM, Plat J. Effects of plant stanol ester consumption on fasting plasma oxy(phyto)sterol concentrations as related to fecal microbiota characteristics. J Steroid Biochem Mol Biol. 2016; doi:10.1016/j.jsbmb.2016.02.029. ID - ref36 ER - TY - JOUR AU - Lozupone, C. AU - Knight, R. PY - 2005 DA - 2005// TI - UniFrac: a new phylogenetic method for comparing microbial communities JO - Appl Environ Microbiol VL - 71 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.71.12.8228-8235.2005 DO - 10.1128/AEM.71.12.8228-8235.2005 ID - Lozupone2005 ER -